企业在向认证机构提出认证申请的同时，需要与认证机构签订认证合同。现以北京航协认证中心的认证合同为例，将各条款规定的内容进行解释：
条款一、内容和要求
1.总则
乙方根据甲方的申请，通过管理体系审核，确认甲方的管理体系是否符合所规定的管理体系标准、产品覆盖范围是否准确，以决定是否批准甲方获得或保持认证／注册资格。甲方为乙方的认证/审核活动提供必要的信息及设施。
理解：
认证机构必须通过现场审核，收集必要的证据，来确定企业的产品覆盖范围及管理体系是否符合要求，并颁发注册证书或者保持注册资格。目前市场上有一些认证机构，在审核组不到现场的情况下，就给企业颁发认证证书，这种行为是违反《中华人民共和国认证认可条例》的，同时会给企业带来不必要的认证风险。所以，企业在申请认证的时候，不能因为操作方便、价格便宜等因素而选择一些不正规操作的认证机构。同时，在现场审核的过程中，企业需要提供必要的帮助（包括硬件、服务、人员的配合等），使得审核能够顺利进行。
2.甲方申请认证领域及依据的管理体系标准：
□质量管理体系认证 □GB/T19001-2008 idt ISO9001:2008
□环境管理体系认证 □GB/T24001-2004 idt ISO14001:2004
□职业健康安全管理体系认证 □GB/T28001-2001
□其它 □其它
其它要求：
理解：企业根据申请选择相应的体系认证及标准。北京航协认证中心杭州分公司除了三大体系认证之外，同时还提供二类国军标认证（民用、非主要军工产品）、二方审核等其他审核及相关的服务。
3.甲方管理体系认证覆盖的产品/服务范围（最终以现场审核时确认为准）
理解：
按照程序，认证合同的签订是在现场审核之前，只有在审核组进入企业现场后，才能正式确认申请企业的产品覆盖范围及描述。此处填写的范围供认证机构合同评审及确定审核组成员用。当然企业能够越准确的描述体系覆盖的产品范围，在现场审核过程中变动也会越少，所以在审核前应尽量与认证机构沟通，使认证机构能够提供更好的服务。
4.甲方管理体系认证的产品/服务范围覆盖部门及分支机构/不在同一市、县的有 处（临时现场另行提供）。
理解：
现在的企业，往往会根据实际需要，在不同的市、县设立长期固定的部门或分支机构（包括：生产车间在异地、销售部门在异地等情况），如这些部门包括在体系覆盖的范围之内，则需要上报认证机构。因为审核认证是一个现场的服务过程，认证机构会考虑地区差异性而适当增加服务时间，以保证现场审核的有效性。还有一类企业有临时现场的情况，特别是工程安装类型的企业，这些企业就要根据要求填写《组织多现场项目调查清单》，以便审核组对工程安装现场做抽样准备。
5.审核时间：
□双方初步约定正式认证审核时间在 年 月 日至 年 月 日期间（具体时间以双方确定的审核计划为准）；
□如需预审，预审时间在 年 月 日至 年 月 日期间。
理解：
最终审核时间的确定，需要根据企业实际情况及认证中心项目安排计划来相互协调。所以合同上约定的只是一个大概的时间范围，认证机构会及时跟企业联系，并参考这个时间范围来最终确定现场审核的具体时间。预审是指在正式的现场审核前，申请认证的企业事先要求认证机构进场审核，以便查找体系运行中企业自身难以发现的问题，并及时整改。预审的目的在于提高企业体系运行的质量，并更好的确保能顺利通过正式审核。当然，预审不是强制性的，也需要收取一定的预审费用，预审费用为3000元/人日。
6.认证需经过下列程序：
a.体系文件审查；
b.现场审核（环境、职业健康安全认证分为第一阶段审核和第二阶段审核）；
c.批准注册，颁发认证证书；
d.证书有效期三年。在三年有效期内共进行二次监督审核，每次审核时间间隔不得超过12个月，证书三年到期前进行再认证审核。
理解：
a.无论企业申请是哪种体系的认证，都会涉及到体系文件的审查。体系文件审查时间，会放在现场审核前。审核组长会提前将体系文件存在的问题反映给企业，等企业修改确认后，再进行现场审核认证。一般情况下，初次申请认证或者企业体系文件换版后，都需要进行文件审查。
b.现场审核过程是企业能够直接接触、感受的认证服务过程。按照认可协会新的要求，质量管理体系（ISO9001认证）、环境管理体系（ISO14001认证）、职业健康安全管理体系（GB/T28001认证）都需要进行一阶段现场审核，北京航协认证中心杭州分公司根据总部要求，并结合企业实际情况，对质量管理体系（ISO9001）的某些专业只需实施一阶段非现场审核，大大方便了企业接受现场审核的过程，提高质量管理体系（ISO9001）审核的服务质量。
c.现场审核通过后，审核组会根据情况出具体系运行的不符合报告。企业应及时整改，使审核组长能够及时关闭不符合项。封闭后的整套审核材料会交北京航协认证中心技术部进行案卷技术评定，评定完成后即可颁发认证证书。
d.企业往往会认为，拿到认证证书后，整个认证过程也就结束了，其实这是片面的理解。企业在初审获得认证证书之后，还需要接受两次年度监督审核，以保持证书的持续有效。同时，一张证书的有效期是三年，在证书三年到期前，企业还应进行再认证审核，重新换发新的认证证书。所以拿到证书只是开始，管理体系的改进与提高不是靠一朝一夕就能实现的。
7.认证必须提交的资料清单详见《认证申请书》第4页
理解：
认证机构在为企业提供审核服务的过程中，是要受到国家相关部门的管理与监控的。企业在申请认证的时候，也需要满足相关的法律法规要求。所以这些企业必须提交相关的资料，以证明企业满足申请条件。